由于面积和空间都很大，空气处理机的风量和风管断面也很大，若将空调机房完全集中在地下室，不仅送回风管占据的建筑平面和空间大，各专业协调困难，而且航站楼的地下室和首层又有旅客行李的传输系统，它几乎占层高的一半，而行李传输系统是航站楼内物流的重要组成部分，各专业的管线都得避让。
　　采取的措施是：地下室的空调机送风对象是1层和部分2层的房间；3层即顶层的空调机送风对象是3层和部分2层的房间，以减少风道占据的建筑面积和空间。而且设在3层的空调机新风的引入更为便利。外区办公室采用新风加双管制的风机盘管方式。内区办公室采用新风加全年送空调冷水的风机盘管方式。
　　专用机房等特殊对象采用自带制冷机的屋顶空调机或分体式空调机。另外在航站楼的首层、进港旅客行李提取厅的东侧，有一个南北长600多的行李分检作业厅，无空调，只设散热器及暖风机。由于该厅有很大的通往停机坪的翻板门，为了防寒在翻板门周边设顶吹的暖风机。